一般来说，非淋菌性尿道炎的发病比较缓慢，在传染后1～3周或更久发病，而淋病多在传染后1～3天内急性发作。非淋菌性尿道炎的症状相对轻，尿道分泌物比较少，多为稀薄粘液，有时仅为痂皮封口或污秽裤裆，但持续时间较长，而且容易反复发作；而淋病症状重，分泌物脓稠，持续时间相对短，治愈后复发较少。如果做分泌物涂片或培养，淋病可见到淋病双球菌，而非淋菌性尿道炎则没有，但经常可培养出衣原体或支原体。
非淋菌性尿道炎的诊断
（一）病史：有婚外性接触史或配偶感染史，通常潜伏期1-3周；
（二）有非淋菌性尿道炎的症状和体征；
（三）实验室检查：诊断分泌物革兰氏染色，油镜下每高倍镜视野中多形核白细胞>4个，而无细胞内淋球菌。或晨尿沉渣每高倍视野白细胞>15个，除外淋病即可诊断。
